Научно-методический совет Учреждения — коллегиальный орган управления Учреждением, который осуществляет организацию и координацию методического обеспечения образовательной деятельности Учреждения.
Научно-методический совет муниципального автономного общеобразовательного учреждения «Гимназия № 48» организует работу предметных и внепредметных кафедр педагогов гимназии, творческих групп, изучает и распространяет передовой педагогический опыт, внедряет в практику работы гимназии новые педагогические методики, руководит научно-исследовательской и опытно-экспериментальной работой гимназии.
В состав Научно-методического совета входит административная команда гимназии, заведующие кафедрами.